Produkter

Ikke-alkoholisk fettleversykdom (NAFLD) har et bredt spekter av sykdomstilstander som spenner fra mild steatose karakterisert ved en unormal retensjon av lipider i leverceller til steatohepatitt (NASH) som viser fettakkumulering, betennelse, ballongdannelse og nedbrytning av hepatocytter, og fibrose.Til syvende og sist kan steatohepatitt resultere i levercirrhose og hepatocellulært karsinom. I denne studien har vi analysert tre forskjellige musestammer, A/J, C57BL/6J og PWD/PhJ, som viser ulike grader av steatohepatitt når de administreres en 3,5-dietoksykarbonyl. -1,4-dihydrokollidin (DDC) som inneholder diett.RNA-Seq genekspresjonsanalyse, proteinanalyse og metabolsk profilering ble brukt for å identifisere differensielt uttrykte gener/proteiner og forstyrrede metabolittnivåer av museleverprøver ved DDC-behandling.Baneanalyse avslørte endring av arakidonsyre (AA) og S-adenosylmetionin (SAMe) metabolisme på andre veier.For å forstå metabolske endringer av arakidonsyremetabolisme i lys av sykdomsekspresjonsprofiler ble en kinetisk modell av denne veien utviklet og optimalisert i henhold til metabolittnivåer.Deretter ble modellen brukt til å studere silico-effekter av potensielle medikamentmål for steatohepatitt. Vi identifiserte AA/eicosanoid-metabolismen som svært forstyrret i DDC-induserte mus ved å bruke en kombinasjon av en eksperimentell og i silico-tilnærming.Vår analyse av AA/eicosanoid metabolske vei antyder at 5-hydroksyeicosatetraensyre (5-HETE), 15-hydroksyeicosatetraensyre (15-HETE) og prostaglandin D2 (PGD2) er forstyrret i DDC-mus.Vi demonstrerer videre at en dynamisk modell kan brukes for kvalitativ prediksjon av metabolske endringer basert på transkriptomiske data i en sykdomsrelatert kontekst.Videre ble SAMe-metabolismen identifisert som forstyrret på grunn av DDC-behandling.Flere gener samt noen metabolitter av denne modulen viser forskjeller mellom A/J og C57BL/6J på den ene siden og PWD/PhJ på den andre.