Produkter

Genomomfattende kromatinimmunutfellingsstudier (ChIP) har brakt betydelig innsikt i den genomiske lokaliseringen av kromatinassosierte proteiner og histonmodifikasjoner.Den store mengden data som genereres av disse analysene, krever imidlertid tilnærminger som muliggjør rask validering og analyse av biologisk relevans.Videre er det fortsatt protein- og modifikasjonsmål som er vanskelige å oppdage ved bruk av standard ChIP-metoder.For å løse disse problemene utviklet vi en umiddelbar kromatin-immunutfellingsprosedyre som vi kaller ZipChip.ZipChip reduserer tiden betydelig og øker følsomheten, noe som muliggjør rask screening av flere loki.Her beskriver vi hvordan ZipChIP muliggjør deteksjon av histonmodifikasjoner (H3K4 mono- og trimetylering) og to gjærhistondemetylaser, Jhd2 og Rph1, som tidligere var vanskelig å oppdage ved bruk av standardmetoder.Videre demonstrerer vi allsidigheten til ZipChIP ved å analysere berikelsen av histon-deacet-ylase Sir2 ved heterochromatin i gjær og berikelse av kromatin-remodelleren, PICKLE, ved euchromatin i Arabidopsis thaliana.