Produkter

Den forutsigbare 3D-strukturen til dobbelttrådet DNA gjør det ideelt egnet som en mal for nedenfra og opp-design av funksjonaliserte nukleinsyrebaserte aktive steder.Vi utforsker her bruken av en 14mer DNA-dupleks som et stillas for presis og forutsigbar posisjonering av katalytiske funksjoner.Gitt den allestedsnærværende deltakelsen av den histidinbaserte imidazolgruppen i proteingjenkjenning og katalysehendelser, ble enkelt histidinlignende modifiserte duplekser undersøkt.Å binde histamin til C5 i tyminbasen via en amidbinding, muliggjør fleksibel plassering av imidazolfunksjonen i hovedsporet.De gjensidige interaksjonene mellom imidazolen og dupleksen og dens innflytelse på imidazolium pKaH blir undersøkt ved å plassere en enkelt modifisert tymin i fire forskjellige posisjoner i midten av 14mer dobbelhelix.Ved å bruke NMR og uhemmet molekylær dynamikk, etableres et strukturelt motiv som involverer dannelsen av en hydrogenbinding mellom imidazolen og Hoogste en-siden av guaninbasene til to tilstøtende GC-basepar.Motivet bidrar til en stabilisering mot termisk smelting på 6°C og er nøkkelen til å modulere pKaH til imidazoliumgruppen.De generelle egenskapene, forutsetningene og generiske karakteren til det nye pKaH-regulerende motivet er beskrevet.