Produkter

Infrarød spektroskopi har blitt brukt for å kartlegge substrat-protein-interaksjoner: konformasjonsendringene av det sarkoplasmatiske retikulum Ca(2+)-ATPase ved nukleotidbinding og ATPase-fosforylering ble overvåket ved bruk av substrat-ATP- og ATP-analogene (2'-deoksy-ATP, 3 '-deoksy-ATP og inosin 5'-trifosfat), som ble modifisert ved spesifikke funksjonelle grupper av substratet.Modifikasjoner av 2'-OH, 3'-OH og aminogruppen til adenin reduserer omfanget av bindingsindusert konformasjonsendring av ATPase, med spesielt sterke effekter observert for de to sistnevnte.Dette demonstrerer den strukturelle følsomheten til nukleotid-ATPase-komplekset for individuelle interaksjoner mellom nukleotid og ATPase.Alle grupper som er studert er viktige for binding og interaksjoner av en gitt ligandgruppe med ATPase avhenger av interaksjoner av andre ligandgrupper.Fosforylering av ATPase ble observert for ITP og 2'-deoksy-ATP, men ikke for 3'-deoksy-ATP.Det er ingen direkte kobling mellom omfanget av konformasjonsendring ved nukleotidbinding og fosforyleringshastigheten, noe som viser at hele omfanget av den ATP-induserte konformasjonsendringen ikke er obligatorisk for fosforylering.Som observert for nukleotid-ATPase-komplekset, avhenger konformasjonen av det første fosforylerte ATPase-mellomproduktet E1PCa(2) også av nukleotidet, noe som indikerer at ATPase-tilstander har en mindre jevn konformasjon enn tidligere forventet.